Чтобы получить список пакетов, установленных в системе, воспользуйтесь командой

sudo dpkg --get-selections "*" > ~/my_packages.txt

Затем этот файл можно скопировать на новую систему и установить пакеты из списка:

sudo dpkg --set-selections < my_packages.txt
sudo apt-get -u dselect-upgrade

Конечно, это относится к дистрибутивам Linux, основанным на Debian.